สเปกตรัมทางคลินิกของโรคภูมิคุ้มกันบกพร่องได้ขยายออกไปตั้งแต่การเจ็บป่วยในซีรั่ม โรคหลอดเลือดอักเสบจากภูมิต้านทานตนเอง-คอลลาเจน และโรคติดเชื้อ ไปจนถึงภาวะแทรกซ้อนของการติดเชื้อเอชไอวีและการบริหารโมโนโคลนอลแอนติบอดีเพื่อการรักษา ภูมิคุ้มกันที่ซับซ้อน การประเมินทางคลินิกของผู้ป่วยที่สงสัยว่าเป็นโรคภูมิคุ้มกันบกพร่องขึ้นอยู่กับการตั้งค่าทางคลินิก การรับรู้ของ vasculitis ผิวหนัง ข้ออักเสบและไตอักเสบ และการตรวจชิ้นเนื้อ