เมแทบอลิซึมของ n-6 และ n-3 EFAs ถูกควบคุมอย่างเข้มงวดโดยการทำงานร่วมกันของเอนไซม์หลายชนิด เช่น desaturases, elongases, cyclooxygenases สารอาหาร (COXs), lipooxygenases (LOXs) และระบบ cytochrome P450 กรดไขมัน N-3 และ n-6 เผาผลาญสารประกอบที่มีการทำงานทางสรีรวิทยาและพยาธิสภาพที่หลากหลาย Eicosanoids ถูกสังเคราะห์จาก n-3 และ n-6 LCPUFAs รวมถึง prostaglandins (PGs), thromboxanes (TXs), leukotrienes (LTs) และกรดไฮดรอกซีไอโคซาเตตระอีโนอิก