ทั้งสองประเภทมีเป้าหมายเดียวกันในการฆ่าหรือป้องกันการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ และทั้งสองประเภทรวมอยู่ในยาเคมีบำบัดต้านจุลชีพ. "ยาต้านแบคทีเรีย" ได้แก่ยาฆ่าเชื้อสบู่ต้านแบคทีเรียและสารเคมีฆ่าเชื้อ ในขณะที่ยาปฏิชีวนะเป็นยาต้านแบคทีเรีย ยาปฏิชีวนะ ประเภท สำคัญที่ใช้โดยเฉพาะในยาและบางครั้งใช้ในอาหารสัตว์