การศึกษานี้ไม่ได้กล่าวถึงสาเหตุที่เป็นเช่นนั้น แต่นักวิจัยคิดว่าอาจเป็นเพราะคนที่กินพืชน้อยลงอาจกินเนื้อจากสัตว์ที่ได้รับยาปฏิชีวนะหรืออาหารแปรรูปที่เติมยาปฏิชีวนะเป็นสารกันบูดแทน ซึ่งอาจสนับสนุน การอยู่รอดของแบคทีเรียดื้อยาปฏิชีวนะสุขภาพจิต. นักวิจัย โครงการ American Gut Project ยังตรวจสอบไมโครไบโอมในลำไส้ของคน 125 คนที่รายงานว่ามีความผิดปกติทางสุขภาพจิต เช่น โรคซึมเศร้า โรคจิตเภท โรคเครียดหลังเหตุการณ์สะเทือนใจ (PTSD) หรือโรคอารมณ์สองขั้ว พวกเขาจับคู่ผู้เข้าร่วมแต่ละคนกับบุคคลที่ไม่มีความผิดปกติทางสุขภาพจิต แต่มีปัจจัยหลักอื่นๆ ที่เหมือนกัน เช่น ประเทศ อายุ เพศ และดัชนีมวลกาย ทีมงานพบว่าผู้ที่มีความผิดปกติทางจิตมีความเหมือนกันกับผู้ที่มีความผิดปกติทางจิตอื่นๆ ในแง่ของแบคทีเรียที่เป็นส่วนประกอบของไมโครไบโอมในลำไส้มากกว่าคนที่มีสุขภาพจิตดี ข้อสังเกตนี้เกิดขึ้นจริงในประชากรทั้งในสหรัฐอเมริกาและสหราชอาณาจักร ในเพศชายและเพศหญิง และในกลุ่มอายุต่างๆ นอกจากนี้